Zhejiang əyalətində Brucella abortus-un ilk tam genom əsaslı izləmə təhlili – Macro & Micro-Test şirkətinin bioinformatika qrupu birgə nəşrə töhfə verir

—— Zhejiang CDC, Macro & Micro-Test və China CDC tərəfindən birgə aparılan tədqiqat, Frontiers in Cellular and Infection Microbiology jurnalında dərc olunub.

Tədqiqata Baxış

2026-cı ilin may ayında Frontiers in Cellular and Infection Microbiology (JCR Q1, IF ≈ 4.6) jurnalı Zhejiang Vilayət Xəstəliklərə Nəzarət və Profilaktika Mərkəzinin (Zhejiang CDC) rəhbərliyi ilə Beijing Macro & Micro-Test Bio-Tech Co., Ltd. şirkətinin bioinformatika komandası və Milli Yoluxucu Xəstəliklərə Nəzarət və Profilaktika İnstitutunun (China CDC) həmmüəllifləri ilə birlikdə bir məqalə dərc etdi. Tədqiqatın adı:
"Çinin Zhejiang əyalətində yeddi Brucella abortus ştammının identifikasiyası və filogenetik təhlili."
Brusella abortusu

Bu tədqiqat Çinin Zhejiang əyalətində Brucella abortus (B. abortus) üçün ilk sistematik, tam genom əsaslı filogenetik izlənilə bilən analizi təmsil edir. Komanda 2015-ci ildən 2025-ci ilə qədər toplanmış yeddi izolatı (Cinhua, Quzhou və Ningbodan dörd insan mənşəli və üç mal-qara mənşəli ştamm) təhlil etmişdir. Tapıntılar, Çinin şərqindəki atipik cənub epidemiya bölgəsində bu "şimal dominant növün" mənşəyi və ötürülmə yolları üçün genomik dəlillər təqdim edir.

 

Arxa plan və əhəmiyyət

 

Brusellyoz, Brucella cinsinə aid bakteriyaların yaratdığı zoonotik bir xəstəlikdir. Brucella abortus əsasən mal-qaraya yoluxur, lakin insanlarda da xəstəliyə səbəb ola bilər. Çində brusellyoz nəzərəçarpacaq coğrafi dəyişikliklər göstərir: ən yüksək insident şimal əyalətlərində (məsələn, Daxili Monqolustan, Şansi, Heilunczyanq) baş verir. Bunun əksinə olaraq, Zhejiang da daxil olmaqla cənub əyalətlərində tarixən Brucella melitensis dominantlıq təşkil edib və B. abortus halları çox az qeydə alınıb. Bu regional fərq, Zhejiangda B. abortusun genetik xarakteristikasını və mənbəyini izləməyi əsas ictimai səhiyyə prioritetinə çevirir.

 

Metodlar və Əsas Tapıntılar

Tədqiqat qrupu molekulyar biologiya və bioinformatikanı birləşdirən çoxşaxəli bir strategiya qəbul etdi:

1.Patogenin müəyyən edilməsi və əsas tipləşdirilməsi

BCSP-31 gen PCR və AMOS-PCR yeddi izolatın hamısının B. abortus olduğunu təsdiqlədi.

Doqquz ev təsərrüfatı geninə əsaslanan Multilocus ardıcıllıq tipləşdirməsi (MLST) bütün izolyatların ST2 ardıcıllıq tipinə aid olduğunu aşkar etdi ki, bu da Zhejiang-da dövran edən B. abortus ştammları arasında yüksək genetik homogenliyi göstərir.
Patogenin müəyyən edilməsi və əsas tipləşdirilməsi

2.Bütün genom xarakteristikası

Bütün genom ardıcıllığı Illumina NovaSeq platformasında aparılmışdır. Orta nukleotid eyniliyi (ANI) təhlili göstərmişdir ki, Zhejiang izolatları B. abortus 544 referans ştammı ilə 99,99%-ə qədər oxşarlığa malikdir.

Pan-genom analizi yüksək dərəcədə qorunmuş populyasiyanı aşkar etdi: yalnız 10 qabıq geni ilə yanaşı 3084 əsas gen müəyyən edildi və yumşaq nüvə və ya bulud genləri aşkar edilmədi.

图片1

 

3.Virulentlik və antimikrob müqavimət gen profilləri

LPS biosintezi, T4SS sekresiya sistemi və BvrR-BvrS iki komponentli tənzimləyici sistem kimi klassik yolları əhatə edən cəmi 68 virulentliklə əlaqəli amil proqnozlaşdırıldı. Qeyd etmək lazımdır ki, bütün izolyatlarda bmaA və btaF adhezin genləri yox idi. Müqavimət geninin təhlili CARD verilənlər bazasında yalnız mprF genini aşkar etdi, digər müqavimət determinantları müəyyən edilmədi.

Virulentlik4. Filogenetik rekonstruksiya və ötürülmənin izlənməsi

Nüvə-genom tək nukleotid polimorfizmi (cgSNP) təhlili Zhejiang izolatlarını qlobal filogenetik ağacda müəyyən bir mövqeyə yerləşdirdi. Nəticələr göstərdi ki, Zhejiang ştammları Rusiya, Monqolustan və bir neçə şimal Çin əyalətindən (Ningxia, Heilongjiang, Daxili Monqolustan, Hebei, Qansu, Pekin) olan ştammlarla birlikdə monofil qrup təşkil edir. Bu qrup daha sonra üç fərqli alt qrupa bölünür (1-3-cü qrup) ki, bu da çoxsaylı müstəqil giriş hadisələrini göstərir.

Filogenetik rekonstruksiya

Nəticələr və Təsirlər

 

Bu tədqiqat, Zhejiang əyalətində B. abortusun ilk yüksək dəqiqlikli genom məlumat dəstini təqdim edir və bir neçə əsas nəticə verir:

 

  1. Clear genetik fon– Zhejiang əyalətində dövr edən B. abortus ştammları ST2-yə aiddir, genomik cəhətdən yüksək dərəcədə qorunub saxlanılır və tipik mal-qara brusellyoz nəslini təmsil edir.

 

2. Eviregionlararası ötürülmə sıxlığı– Filogenetik analiz Çjetszyan əyalətində müstəqil endemik bir nəslin mövcudluğunu dəstəkləmir. Əksinə, məlumatlar bu ştammların Şimali Çindən qaynaqlandığını və Rusiya və Monqolustan ştammları ilə ortaq bir təkamül keçmişinə sahib ola biləcəyini güclü şəkildə göstərir. Üç alt qruplaşmanın olması birdən çox ayrı giriş hadisəsini nəzərdə tutur.

 

3. İctimai səhiyyəyə təsirləri– Tapıntılar, hətta ənənəvi olaraq endemik olmayan bölgələrdə, məsələn, Zhejiang əyalətində belə, bruselloz üçün genomik müşahidənin dəyərini vurğulayır. Hazırkı yoluxma hallarının sayı az olsa da, cgSNP kimi yüksək dəqiqlikli alətlər idxal olunan epidemiyaların mənbəyini effektiv şəkildə izləyə və əyalətlərarası mal-qaranın daşınması ilə əlaqəli ötürmə zəncirlərini kəsmək üçün elmi dəlillər təqdim edə bilər.

 

Bu iş yalnız Zhejiang əyalətindəki tədqiqat boşluğunu doldurmaqla yanaşı, Yantszi çayı deltası bölgəsində patogen nəzarəti və brusellyoz riskinin qiymətləndirilməsi üçün yeni ilkin məlumatlar təqdim edir.

 

Kağız Məlumatı:
Yang, Y., Shi, X., Chen, J., Wang, L., Wu, Z., Yao, W., … & Wu, B. (2026). Çinin Zhejiang əyalətində yeddi Brucella abortus ştammının identifikasiyası və filogenetik təhlili. Hüceyrə və İnfeksiya Mikrobiologiyasında Sərhədlər, 16, 1758965.

 

 


Yazı vaxtı: 10 iyun 2026