Vərəmin Diaqnozu və Dərman Müqavimətinin Aşkarlanması üçün Yeni Silah: Vərəmin Həddindən artıq Həssaslıq Diaqnozu üçün Maşın Öyrənilməsi ilə Birləşdirilmiş Yeni Nəsil Hədəfli Sıralama (tNGS)
Ədəbiyyat hesabatı: CCa: az bakterial vərəm və vərəmli meningiti olan insanlar üçün uyğun olan tNGS və maşın öyrənməsinə əsaslanan diaqnostik model.
Dissertasiyanın adı: Vərəmə yönəlmiş növbəti nəsil ardıcıllığı və maşın öyrənməsi: zəif ağciyər boruları və borulu meningit üçün ultra həssas diaqnostik strategiya.
Dövri nəşr: 《Clinica Chimica Acta》
ƏGƏR: 6.5
Dərc tarixi: Yanvar 2024
Çin Elmlər Akademiyası Universiteti və Paytaxt Tibb Universitetinin Pekin Sinə Xəstəxanası ilə birlikdə Macro & Micro-Test yeni nəsil hədəflənmiş ardıcıllıq (tNGS) texnologiyası və maşın öyrənmə metodu əsasında vərəm diaqnozu modelini qurdu. az bakteriya və vərəmli meningiti olan vərəmin aşkarlanması həssaslığı, iki növ vərəmin klinik diaqnostikası üçün yeni hiperhəssaslıq diaqnostikası metodunu təmin etdi və vərəmin dəqiq diaqnozu, dərman müqavimətinin aşkarlanması və müalicəsinə kömək etdi.Eyni zamanda, aşkar edilmişdir ki, xəstənin plazma cfDNA-sı TBM diaqnostikasında klinik nümunə götürmə üçün uyğun nümunə növü kimi istifadə edilə bilər.
Bu tədqiqatda 227 plazma nümunəsi və serebrospinal maye nümunələri iki klinik kohort yaratmaq üçün istifadə edilmişdir, burada laboratoriya diaqnostik kohort nümunələri vərəm diaqnozunun maşın öyrənmə modelini yaratmaq üçün istifadə edilmişdir və klinik diaqnostik kohort nümunələri müəyyən edilmiş məlumatları yoxlamaq üçün istifadə edilmişdir. diaqnostik model.Bütün nümunələr əvvəlcə Mycobacterium tuberculosis üçün xüsusi hazırlanmış hədəflənmiş tutma zond hovuzu tərəfindən hədəfə alındı.Daha sonra, TB-tNGS sıralama məlumatlarına əsaslanaraq, qərar ağacı modeli laboratoriya diaqnostik növbəsinin təlim və təsdiqləmə dəstlərində 5 qat çarpaz doğrulama həyata keçirmək üçün istifadə olunur və plazma nümunələrinin və onurğa beyni mayesi nümunələrinin diaqnostik hədləri əldə edilir.Alınan həddi aşkar etmək üçün klinik diaqnostika növbəsinin iki test dəstinə gətirilir və şagirdin diaqnostik performansı ROC əyrisi ilə qiymətləndirilir.Nəhayət, vərəmin diaqnoz modeli əldə edildi.
Şəkil 1 tədqiqat layihəsinin sxematik diaqramı
Nəticələr: Bu tədqiqatda müəyyən edilmiş CSF DNT nümunəsinin (AUC = 0,974) və plazma cfDNA nümunəsinin (AUC = 0,908) xüsusi hədlərinə əsasən, 227 nümunə arasında CSF nümunəsinin həssaslığı 97,01%, spesifiklik 95,65% və plazma nümunəsinin həssaslığı və spesifikliyi 82,61% və 86,36% idi.TBM xəstələrindən plazma cfDNA və serebrospinal maye DNT-nin 44 cütləşdirilmiş nümunəsinin təhlilində bu tədqiqatın diaqnostik strategiyası plazma cfDNA və serebrospinal maye DNT-də 90,91% (40/44) yüksək konsistensiyaya malikdir və həssaslıq 95,45% təşkil edir. (42/44).Ağciyər vərəmi olan uşaqlarda bu tədqiqatın diaqnostik strategiyası eyni xəstələrdən alınan mədə şirəsi nümunələrinin Xpert aşkarlama nəticələrinə nisbətən plazma nümunələrinə daha həssasdır (28,57% VS 15,38%).
Fig. 2 Əhali nümunələri üçün vərəm diaqnoz modelinin təhlili performansı
